本发明属于杀菌材料技术领域，公开了非渗透性的含聚硅氧烷的嵌段共聚物及其制备方法和应用。具有式(Ⅰ)结构的含聚硅氧烷的嵌段共聚物：其中，n的取值为1?280，m的取值为30?400；b表示两个括号里的长链之间是嵌段结构；*表示取代的位置。相对于现有市售的小分子季铵盐杀菌剂，本发明所提出的具有式(Ⅰ)结构的含聚硅氧烷的嵌段共聚物具有更大的分子量，由于其分子体积巨大，难以渗透通过皮肤表皮，且可在皮肤表面有效吸附，尤其适合作为表皮长效杀菌剂使用。