本发明公开了一种超亲水的主链型季铵盐及其制备方法与应用。本发明通过在有机溶剂A中加入卤代烷，然后在惰性气体气氛中加入二胺类化合物进行反应，实现一锅法制备大分子季铵盐；通过控制卤代烷与二胺类化合物的投料比，可以制备得到不同分子量以及不同亲水性的主链型季铵盐。所得到的超亲水的主链型季铵盐为大分子，且因为其所含烷烃链段极短，故极易溶于水，难于溶于各类高极性的有机溶液，具备分子量大和超亲水的特点，故可保持较强的抑菌活性的同时有效降低季铵盐的环境毒性，广泛应用于防治水稻纹枯病和香蕉枯萎病。