本发明属于高分子材料制备技术领域，公开了一种高粘度耐水解聚对苯二甲酸丁二醇酯的制备方法。将聚对苯二甲酸丁二醇酯原料100份、含至少一个碳碳双键的官能团单体扩链剂A0.01～5份和既含碳碳双键又含环氧基团的官能团单体扩链剂B0.01～5份混合均匀，然后加入到挤出机中反应挤出，挤出机加料段温度160～210℃、熔融段温度220～250℃、均化段温度250℃，同时对挤出机熔融段或均化段的物料施加紫外光辐照，挤出产物即为高粘度耐水解聚对苯二甲酸丁二醇酯。本发明利用挤出机和复合扩链剂，以及紫外光辐照条件，采用两步法制备高粘度耐水解聚对苯二甲酸丁二醇酯，反应时间短，反应速度快，设备简单。