本发明属于生物材料的技术领域，公开了一种肝素的叠氮化修饰方法和叠氮化肝素及应用。所述方法包括以下步骤：（１）采用活化试剂将含有羧基的叠氮化合物进行活化处理，得到活化的叠氮化合物；所述活化处理的条件为：在０～室温下反应１～１４ｈ；（２）向步骤（１）的活化的叠氮化合物中加入肝素盐溶液，调节ｐＨ至７～９，于０～室温下进行反应，透析去除小分子，干燥，得到叠氮化肝素。本发明的方法简单，成功将叠氮基团修饰到肝素分子链上，得到了叠氮化肝素。所述的叠氮化肝素能够较好的改性生物材料，将肝素以化学键的形式引入生物材料中，拓展了肝素的应用领域。