本发明涉及降低芸豆凝集素血凝活性且提高其促α－淀粉酶抑制活性的方法，包括步骤：芸豆粗提物的制备；硫酸铵沉淀；６０ＭＰａ～１５０ＭＰａ下微射流均质处理一次或两次；２００ＭＰａ－５００ＭＰａ超高压处理１０ｍｉｎ～１５ｍｉｎ；将处理后的芸豆粗提物取出，经冷冻干燥得到芸豆粗提物粉末。经本发明处理以后，芸豆粗提物中的凝集素血凝活性降低同时促α－淀粉酶抑制活性提高，即一方面有效的降低了芸豆的抗营养性，另一方面提高了其有益的促α－淀粉酶抑制活性。