本发明公开了一种碱性离子液体催化葡萄糖异构制备果糖的方法。该方法以碱性离子液体和葡萄糖为原料，加入水为溶剂；葡萄糖在体系中浓度为0.1?1mol/L；离子液体催化剂对葡萄糖浓度为10?30mol％；反应温度为70?120℃；反应时间为10?60min；所得葡萄糖转化率为47?59％，果糖收率为35?37％。所述离子液体催化剂为由阳离子和阴离子构成的碱性功能化离子液体；所述阳离子为烷基取代咪唑、季铵或烷基取代吗啡啉；阴离子为羧酸根、氢氧根、碳酸根或脯氨酸根。本发明离子液体催化剂还具备“绿色性”和不挥发性，且可实现循环实验，具有显著的环境友好优越性。