本发明属于特异性分子识别材料领域，公开了一种部花菁类荧光化合物及其制备方法和应用。所述部花菁类荧光化合物的结构通式如式(I)所示。本发明的荧光化合物，采用经典的花菁类染料结构，在R基位置引入电中性的吸电子基团，使其结构中的给电子基团和吸电子基团形成了推?拉电子作用的共轭结构，并通过碳碳双键增加跃迁的共轭体系，使化合物分子产生的荧光向近红外区移动，同时引入的电中性基团解决了大部分带电荷的花菁类化合物无法通过血脑屏障的问题。该化合物分子对Aβ斑块具有亲和力，能够成功用于Aβ斑块的近红外荧光显像，具有安全无放射性、成本低廉、背景荧光干扰较低、在生物组织中穿透力强等优点。