本发明公开了一种快速启动厌氧氨氧化耦合反硝化协同脱氮反应器的方法，采用厌氧氨氧化和反硝化的混合污泥为接种污泥，混合体积比为4:1，MLVSS比为0.89:1，接种量为1000mL，进水采用NH4Cl和NaNO2为氮源，NaHCO3和C6H12O6为碳源。所述进水采用连续输入的方式，使进水与污泥接触后，反应生成的气体从反应器顶部的排气孔排出，出水由反应器上部的溢流堰流出。所述进水pH调节为7.5~8.0，水力停留时间HRT为10?14h，在常温条件下运行。本发明实现了厌氧氨氧化菌和反硝化菌的协同脱氮，脱氮效率高达95.1%。