本发明属于红外材料的技术领域，公开了一种锰系反尖晶石相高发射率红外颜料及其制备方法。所述方法为（１）将电解ＭｎＯ２、Ｃｏ２Ｏ３进行混合处理，得到混合物；（２）将混合物放入匣钵中，密封，再置于微波烧结炉中进行微波加热，停止微波，保温，出料，得到粉末产物；（３）将粉末产物、电解ＭｎＯ２、镍源、铜源、亚铁源、锌源和水进行混合处理，得到共混物；（４）将共混物放入保温装置中，密封，置于微波装置微波加热，停止微波，保温，出料，得到高发射率红外颜料；（５）或者将共混物放入保温装置中，密封，置于微波装置微波加热，停止微波，急冷，得到红外颜料。本发明的红外颜料颗粒均匀、细小，红外性能优良。