本发明公开了一种血管内超声影像的血管中内膜分割方法，包括步骤：S1.收集血管内超声图像数据，并对每幅血管内超声图像中的中内膜区域进行标注；S2.对训练集图像进行极坐标变换；S3.计算标记图的边缘距离图；S4.设定滑动采样窗口并确定窗口大小和滑动步长；S5.构建并训练FusionNet深度学习分割模型；S6.输入新数据并得到分割结果。本发明方法能够快速、准确、有效地提取血管中内膜区域。