本发明涉及一种非均匀过采样数字控制器及其控制方法，属电子电路技术领域。一种非均匀过采样数字控制器，包括比例?积分?微分补偿器和根据输入信号改变分辨率进行采样与量化的非均匀过采样ADC，所述的非均匀过采样ADC设有用于与开关变换器拓扑的输出连接的第一输入端和用于与参考信号连接的第二输入端，所述的非均匀过采样ADC的输出端与所述的比例?积分?微分补偿器的输入端连接，所述的比例?积分?微分补偿器设有输出端。本发明还公开了一种非均匀过采样数字控制器的控制方法。本发明的一种非均匀过采样数字控制器及其控制方法具有结构简单、转换时间短、精度高、稳定性好的优点。