本发明公开了一种基于多高斯核自优化相关向量机的污水水质软测量方法，包括以下步骤：１）剔除污水输入和输出的数据中的异常点，由于各输入变量量纲的不同，对其进行归一化处理，归一化到［０，１］区间中；２）多高斯核函数相关向量机软测量模型模块；３）多高斯核函数核参数自优化算法；４）遗传优化算法对初始参数寻优模块；５）多高斯核函数自优化相关向量机软测量模型建模。本发明通过自优化方法确定各尺度上的核参数，运用遗传优化算法对初始参数寻优，建立最优模型，在保证模型收敛性和稀疏性的情况下，有效提高污水中ＢＯＤ输出精度。