本发明公开了一种两维分析同时进行的停流型二维液相色谱及其应用，本发明的色谱系统采用多通阀封闭第一维色谱柱两端的方式实现停流，大大改善了压力保持效果，压力波动干扰更小，再采用另一根与该第一维色谱柱压降相等的色谱柱作为压力平衡柱，使得第一维色谱柱停流后第一维输液泵仍可不断流，从而可接入第一维检测器对第一维色谱柱流出组分进行检测。此外，第二维液相色谱进样前，采用柱后分流器对其进行分流处理，从而解决了上样量过大的问题。　１