本发明提供了一种基于最小误码率准则的水下通信Ｔｕｒｂｏ接收系统及方法，即ＳＩＳＯ均衡器使用的是最小误码率准则，将Ｔｕｒｂｏ码的前级译码器结构替换为ＳＩＳＯ均衡器，将均衡器输出的外部软信息与译码器输出的外部软信息进行循环迭代。所述接收系统包括：最小误码率均衡模块、解交织模块、ＭＡＰ译码器模块、判决模块、交织模块以及映射模块。本发明直接基于最小误码率设计水声信道均衡器，采用Ｔｕｒｂｏ结构，均衡器和信道解码器之间迭代交换软信息，Ｔｕｒｂｏ接收机的均衡器在每一次迭代中基于最小误符号率准则更新。具有灵活性高、均衡效果好等优点。