本发明公开了一种具有无线能量收集能力的水声通信系统资源分配方法与装置，该方法在骨干网基站或中心节点处布置水声换能器阵列，通过波束成形技术优化基站水声换能器阵列的权值矩阵，使基站发射的水声信号对准水下终端节点。水下终端节点接收到的声波信号在通过水声换能器转化为电信号后，利用功率分离器分离为两路信号流，其中一路信号进行信号检测；另一路信号则通过能量收集模块进行能量收集，收集的能量通过电源模块对终端节点的电池进行充电，从而实现终端节点的能源补充。该方法在保证通信质量的前提下获得最大的终端节点收集能量，从而最大限度的为水声通信网络终端节点进行能源补充。