本发明公开了一种光照部分被遮挡的光伏阵列电路重构系统及其方法。所述系统包括光伏阵列电路、光伏板支路切换电路、旁路电路、电量检测与分析电路和PLC功率优化模块；所述光伏阵列电路包括N行M列的光伏板，每块光伏板先与所述支路切换电路串联，每列光伏板与所述旁路电路并联；每块光伏板均与对应列中的电量检测与分析电路连接，各列电量检测与分析电路均与PLC功率优化模块连接。所述方法包括以下步骤：步骤一、对重构电路的功率进行计算；步骤二、找出功率达到最大时需旁路的列数，保证光伏阵列的输出功率达到最优。基于输出电压和功率要求重构光伏阵列的发电电路，改善非均匀光照下光伏发电的效率。