本实用新型公开了一种带有谐振抑制功能的伺服控制系统，包括：控制模块、功率电路模块、电机测速模块以及通信监视模块；所述功率电路模块包括不控整流桥、三相逆变器、驱动电路以及三相电流采样电路；所述电机测速模块包括光电编码器、永磁同步电机以及谐振负载；所述通信监视模块包括上位机以及操作面板；所述控制模块包括谐振频率在线辨识与抑制模块、SVPWM输出模块、角度计算模块以及AD转换模块；所述操作面板与控制模块信号连接，所述SVPWM输出模块输出端与所述驱动电路连接，所述三相电流采样电路输出端与AD转换模块连接，所述角度计算模块输入端与光电编码器连接。本实用新型可以有效解决伺服系统中的高频谐振问题。